Os fundos da Biblioteca Central de Marinha têm várias origens, mas no caso dos fundos antigos, é de salientar a importância dos recebidos das livrarias dos conventos das Ordens religiosas extintas em Portugal no ano de 1834. Conta com preciosas colecções de livros de Astronomia, Geometria, Aritmética, Geografia, Cartografia, História e outros assuntos.

Importantes legados têm enriquecido o património da Biblioteca, destacando-se, entre outros, os dos Almirantes Gago Coutinho e Teixeira da Mota, os dos Comandantes Marques Esparteiro e Nunes Ribeiro e ainda o da “Família Almeida d’Eça”, que muito vieram enriquecer o vasto património já existente em matéria de história náutica e de descobrimentos. Igualmente de sublinhar a existência de uma importante colecção de cartas geográficas, de cartas marítimas e de atlas, cujos mais antigos datam do século XVI e são exemplares únicos em bibliotecas nacionais.

Por tudo isto, a Biblioteca Central de Marinha é um importante centro bibliográfico e documental para o estudo de temas de História dos Descobrimentos e Expansão, Ultramar, Marinha e Assuntos do Mar.